Sekolah Menengah Pertama Islam Terpadu Al Fatih  didirikan pada tahun 2017 dibawah naungan Yayasan Muhammad Al Fatih. Tokoh yang paling berjasa dalam merintis  lahirnya SMP IT Al Fatih  adalah bapak dr. Adnan Ibrahim, Sp,PD. Dokter Adnan adalah salah seorang dokter spesialis penyakit dalam di rumah sakit Balai Besar Kesehatan Paru Masyarakat Makassar (BBKPM Makassar) yang memiliki jiwa religius dan sosial yang tinggi. Berawal dari keprihatinan akan karakter generasi bangsa yang semakin  terkikis dan pentingnya pendidikan anak sejak usia dini, maka muncullah gagasan untuk mendirikan yayasan Muhammad Al fatih, yang bergerak dalam bidang pendidikan salah satunya didirikanlah SMP IT Al Fatih pada tanggal 12 Februari 2017 yang berlokasi di jalan Domba no 12 Makassar yang kini berlokasi di Jl. A. Mappanyukki no. 50.  Langkah berikutnya dilembagakan dan mengajukan perizinan ke Dinas kota. Surat Perizinan  dari Dinas Pendidikan Kota Makassar terbit tanggal 5 Oktober 2018.

        Selanjutnya kami terus berbenah diri dan mengembangkan diri dengan mengikuti pelatihan dan belajar Mandiri. Di tahun ke dua berdirinya. Yaitu 2018,  SMP IT AL Fatih berhasil mendapatkan akreditasi B.